Composé d’agents de haut niveau, l’EPTB peut intervenir sur les nombreuses thématiques présentes sur le bassin versant. L’Établissement rassemble ainsi des experts, ingénieurs et techniciens diplômés dans des domaines complémentaires, qui sont à la disposition des collectivités pour élaborer des programmes, mettre en œuvre des projets et apporter un appui aux structures locales d’aménagement et de gestion de l’eau.
Au cours du temps, l’EPTB a renforcé et diversifié ses compétences avec des agents spécialisés de haut niveau : ingénieurs en génie civil, spécialistes des risques naturels, ingénieurs en environnement, hydrauliciens, hydrobiologistes, géomorphologues, géomaticiens, hydrogéologues, écologues…